Предполагается, что первые растения будут играть важную роль в образовании протогрунта достаточного плодородия, необходимой для целевого выращивания второго поколения растений, таких как пшеница, рис, соя и др. Остатки растений первого поколения могли бы быть компостированный и преобразованы микроорганизмами в подобный к почве субстрат в регенеративной системе жизнеобеспечения. Лунный реголит может быть использовано в качестве субстрата для выращивания растений в начале миссии, чтобы сократить расходы. Использование микробных сообществ для праймирования растений позволит облегчить адаптацию к стрессовым условиям и обеспечить развитие растения в неблагоприятных условиях. Хорошо охарактеризованы, ассоциированные с растениями бактерии использовались для выращивания трех сортов бархатцев (Tagetes patula L.) в анортозите, субстрате низкой биодоступности, аналогичном лунной горной породе. Консорциум состоял из бактерии Paenibacillus sp. IMBG156 и ризобактерий, способствующие росту растений, который стимулировал прорастания семян, улучшал развитие растений и, в конечном итоге, цветение инокулированных бархатцев. В противоположность этому, контрольные растения плохо росли в анортозите и практически не доживали до цветения. Анализ состава бактериального сообщества показал, что все виды бактерий колонизировали корни растений, однако уровень колонизации зависел от алелопатичных характеристик видов бархатцев. Бактерии консорциума способны высвобождать некоторые элементы (Са, Fe, Mn, Si, Ni, Cu, Zn) с анортозита. Колонизация растений смешанной культурой бактериальных штаммов приводила к увеличению накопления растением К, Mg, Mn и снижение уровня накопления токсичных металлов. Предполагается, что рационально подобранный консорциум бактериальных штаммов способствовал прорастанию семян бархатцев и поддерживал развитие растений в неблагоприятных для роста условиях с помощью выздоровления необходимых для растений питательных элементов и защиты растений против сверхнакопления некоторых токсических металлов.